Dans le sol le domaine des eucaryotes est constitué de différents groupes d'organismes.
A un niveau taxonomique élevé (les règnes), on trouve les protozoaires, les plantes, les champignons et les animaux. Les animaux sont eux-mêmes composés d'une grande diversité de groupes d'organismes
Chacun de ces domaines, règnes et groupes taxonomiques est constitué d'une extraordinaire diversité d'espèces . Par exemple, on connaît dans le sol, 300.000 espèces de Coléoptères, 30.000 espèces de nématodes...
Le sol est un milieu encore mal connu du point de vue de cette biodiversité et il reste encore beaucoup d'espèces à décrire.
On estime à 800.000 le nombre d'espèces de champignons, seulement 10% environ étant actuellement connu.
Auteurs: Eric Blanchart - Joséphine Peigné -Jean-François Vian