Le dispositif d'analyse officiel comprend deux niveaux : un réseau de laboratoires agréés et des laboratoires nationaux de référence. Les laboratoires agréés sont choisis par le ministère de l'Agriculture et, plus particulièrement, la DGAL (Direction générale de l'alimentation), pour réaliser des analyses officielles de routine sur des organismes nuisibles réglementés qui peuvent être des virus, des viroïdes, des phytoplasmes, des bactéries, des champignons, des nématodes, mais aussi des insectes et des acariens. Ces organismes peuvent être de quarantaine ou réglementés.

Une méthode officielle d'analyse (MOA) est publiée par le ministère de l'Agriculture et plus particulièrement par la DGAL qui doit être utilisée par les laboratoires agréés dans le cadre d'analyses officielles.