La PCR : rappels et mise à niveau

Réalisation pratique d'une réaction de PCR

Pour réaliser une réaction de PCR, il faut établir le mélange réactionnel suivant :

  1. l'ADN matrice,

  2. les amorces oligonucléotidiques à partir desquelles la polymérisation de l'ADN s'enclenche,

  3. les désoxyribonucléotides qui sont incorporés dans l'ADN (dATP, dCTP, dGTP et dTTP),

  4. la TAQpolymérase,

  5. une solution tampon appropriée au bon fonctionnement de la TAQpolymérase.

Il existe différents types de TAQpolymérase commercialisés. Elles sont protégées par des brevets. Elles présentent des fiabilités, des vitesses de synthèse et donc des coûts différents.

Une TAQpolymérase "classique" synthétise 2000 bases par minute pour un coût compris entre 0,1 et 0,5 euros par réaction de PCR.

Il faut tenir compte de la vitesse de synthèse d'ADN pour déterminer la durée de l'étape de polymérisation de l'ADN réalisée à 72°C.

Méthode

La réaction de PCR est réalisée grâce à un appareil appelé thermocycleur.

Un thermocycleur n'est rien d'autre qu'un bain marie perfectionné qui peut changer rapidement de température pour respecter les consignes de température et de durée choisies par l'expérimentateur.

Schéma de la mise en œuvre d'une amplification[Zoom...]

Pour plus d'informations, une vidéo est à votre disposition :

Explication de la PCR
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