Il est souvent tentant pour les agriculteurs-éleveurs (en particulier pour l'élevage laitier) d'utiliser l'avoine comme fourrage dans son intégralité. Dans un tel cas, les effets positifs liés au semis direct et en particulier au gain de matière organique seront fortement réduits, voire nuls. L'exportation de l'avoine en fourrage doit donc être raisonnée, sur la base d'un compromis entre intérêt économique à court terme pour la production animale et intérêt agronomique à plus long terme de maintenir un stock suffisant de matière organique pour un bon fonctionnement biologique des sols.